MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Cyanothece sp. ATCC 51142 plasmid B

Total Repeats: 561

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_010541	GAA	2	6	128	133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
2	NC_010541	TAG	2	6	182	187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
3	NC_010541	TAA	2	6	190	195	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034860
4	NC_010541	GTG	2	6	265	270	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034860
5	NC_010541	CTT	2	6	291	296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
6	NC_010541	AAC	2	6	335	340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034860
7	NC_010541	GAT	2	6	357	362	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034860
8	NC_010541	CTG	2	6	373	378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
9	NC_010541	CTG	2	6	403	408	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
10	NC_010541	AT	3	6	469	474	50 %	50 %	0 %	0 %	172034860
11	NC_010541	GAA	2	6	528	533	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034860
12	NC_010541	TCAGTT	2	12	544	555	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	172034860
13	NC_010541	T	6	6	560	565	0 %	100 %	0 %	0 %	172034860
14	NC_010541	GA	3	6	611	616	50 %	0 %	50 %	0 %	172034860
15	NC_010541	TTA	2	6	675	680	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
16	NC_010541	TCT	3	9	681	689	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034860
17	NC_010541	CTG	2	6	745	750	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034860
18	NC_010541	ACT	2	6	809	814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034860
19	NC_010541	TTA	2	6	879	884	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034860
20	NC_010541	ATC	2	6	1439	1444	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034861
21	NC_010541	CCA	2	6	1479	1484	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034861
22	NC_010541	AGC	2	6	1498	1503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
23	NC_010541	ATT	2	6	1646	1651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034861
24	NC_010541	CGA	2	6	1678	1683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
25	NC_010541	CGG	2	6	1904	1909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034861
26	NC_010541	AGC	2	6	1927	1932	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034861
27	NC_010541	TCAA	2	8	1950	1957	50 %	25 %	0 %	25 %	172034861
28	NC_010541	A	6	6	2029	2034	100 %	0 %	0 %	0 %	172034862
29	NC_010541	TGA	2	6	2049	2054	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034862
30	NC_010541	TAA	2	6	2073	2078	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034862
31	NC_010541	TCA	2	6	2092	2097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034862
32	NC_010541	CAA	2	6	2102	2107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
33	NC_010541	A	8	8	2121	2128	100 %	0 %	0 %	0 %	172034862
34	NC_010541	ATCT	2	8	2164	2171	25 %	50 %	0 %	25 %	172034862
35	NC_010541	CAA	2	6	2188	2193	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034862
36	NC_010541	TGAG	2	8	2228	2235	25 %	25 %	50 %	0 %	172034862
37	NC_010541	A	6	6	2532	2537	100 %	0 %	0 %	0 %	172034863
38	NC_010541	GAC	2	6	2624	2629	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034863
39	NC_010541	TTG	2	6	2684	2689	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034863
40	NC_010541	T	6	6	2748	2753	0 %	100 %	0 %	0 %	172034864
41	NC_010541	A	6	6	2782	2787	100 %	0 %	0 %	0 %	172034864
42	NC_010541	ATA	2	6	2791	2796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034864
43	NC_010541	CTTA	2	8	2828	2835	25 %	50 %	0 %	25 %	172034865
44	NC_010541	A	7	7	2858	2864	100 %	0 %	0 %	0 %	172034865
45	NC_010541	T	6	6	2865	2870	0 %	100 %	0 %	0 %	172034865
46	NC_010541	CTG	2	6	2927	2932	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034865
47	NC_010541	ACA	2	6	2947	2952	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034865
48	NC_010541	C	6	6	3097	3102	0 %	0 %	0 %	100 %	172034866
49	NC_010541	CAG	2	6	3128	3133	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
50	NC_010541	GAC	2	6	3162	3167	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
51	NC_010541	GCT	2	6	3206	3211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034866
52	NC_010541	CTAGGA	2	12	3309	3320	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	172034866
53	NC_010541	ATT	3	9	3454	3462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
54	NC_010541	CGG	2	6	3536	3541	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
55	NC_010541	AAT	2	6	3564	3569	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
56	NC_010541	TCT	2	6	3592	3597	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
57	NC_010541	CCA	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
58	NC_010541	CCA	2	6	3709	3714	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
59	NC_010541	GTG	2	6	3835	3840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
60	NC_010541	ATC	2	6	3876	3881	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
61	NC_010541	TTA	2	6	3970	3975	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
62	NC_010541	TGG	2	6	4011	4016	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
63	NC_010541	A	6	6	4028	4033	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
64	NC_010541	TGA	2	6	4046	4051	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
65	NC_010541	ACC	2	6	4158	4163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
66	NC_010541	ACCT	2	8	4207	4214	25 %	25 %	0 %	50 %	172034866
67	NC_010541	ACC	2	6	4269	4274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034866
68	NC_010541	TTAA	2	8	4278	4285	50 %	50 %	0 %	0 %	172034866
69	NC_010541	ATGAAA	2	12	4300	4311	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	172034866
70	NC_010541	GAC	2	6	4515	4520	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
71	NC_010541	GTT	2	6	4542	4547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
72	NC_010541	TAT	2	6	4550	4555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
73	NC_010541	TC	3	6	4661	4666	0 %	50 %	0 %	50 %	172034866
74	NC_010541	AAAC	2	8	4742	4749	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
75	NC_010541	TAA	3	9	4778	4786	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
76	NC_010541	GTG	2	6	4854	4859	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034866
77	NC_010541	TTA	2	6	4878	4883	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
78	NC_010541	TGA	2	6	4892	4897	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
79	NC_010541	TTAT	2	8	4899	4906	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
80	NC_010541	AAGG	3	12	4912	4923	50 %	0 %	50 %	0 %	172034866
81	NC_010541	A	6	6	4956	4961	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
82	NC_010541	TATT	2	8	5016	5023	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
83	NC_010541	T	6	6	5082	5087	0 %	100 %	0 %	0 %	172034866
84	NC_010541	CTT	3	9	5090	5098	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
85	NC_010541	TGAT	2	8	5104	5111	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
86	NC_010541	ATT	2	6	5130	5135	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
87	NC_010541	TTAT	2	8	5165	5172	25 %	75 %	0 %	0 %	172034866
88	NC_010541	ATA	2	6	5206	5211	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
89	NC_010541	CTA	2	6	5433	5438	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
90	NC_010541	A	6	6	5508	5513	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
91	NC_010541	AAAC	2	8	5534	5541	75 %	0 %	0 %	25 %	172034866
92	NC_010541	ATG	2	6	5611	5616	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
93	NC_010541	CCT	2	6	5617	5622	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034866
94	NC_010541	GAA	2	6	5625	5630	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034866
95	NC_010541	TACCT	2	10	5663	5672	20 %	40 %	0 %	40 %	172034866
96	NC_010541	TTAC	2	8	5762	5769	25 %	50 %	0 %	25 %	172034866
97	NC_010541	AGTT	2	8	5821	5828	25 %	50 %	25 %	0 %	172034866
98	NC_010541	A	6	6	6021	6026	100 %	0 %	0 %	0 %	172034866
99	NC_010541	GTT	2	6	6059	6064	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034866
100	NC_010541	CT	3	6	6080	6085	0 %	50 %	0 %	50 %	172034866
101	NC_010541	ACG	2	6	6092	6097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034866
102	NC_010541	GGC	2	6	6188	6193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034866
103	NC_010541	AT	3	6	6253	6258	50 %	50 %	0 %	0 %	172034866
104	NC_010541	AAT	2	6	6294	6299	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034866
105	NC_010541	ATGG	2	8	6354	6361	25 %	25 %	50 %	0 %	172034866
106	NC_010541	TAC	2	6	6419	6424	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034866
107	NC_010541	ATT	2	6	6570	6575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034866
108	NC_010541	GAT	2	6	6678	6683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034866
109	NC_010541	CTT	2	6	6704	6709	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034866
110	NC_010541	TC	3	6	6796	6801	0 %	50 %	0 %	50 %	172034867
111	NC_010541	CAG	2	6	6852	6857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034867
112	NC_010541	CAC	2	6	6877	6882	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034867
113	NC_010541	AATC	2	8	6903	6910	50 %	25 %	0 %	25 %	172034867
114	NC_010541	TTG	2	6	6956	6961	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
115	NC_010541	CAA	2	6	6966	6971	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034867
116	NC_010541	GGT	2	6	6975	6980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034867
117	NC_010541	CCAA	2	8	6994	7001	50 %	0 %	0 %	50 %	172034867
118	NC_010541	TTG	2	6	7033	7038	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034867
119	NC_010541	CAAA	2	8	7113	7120	75 %	0 %	0 %	25 %	172034867
120	NC_010541	GCT	2	6	7125	7130	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034867
121	NC_010541	TCAG	2	8	7294	7301	25 %	25 %	25 %	25 %	172034868
122	NC_010541	CT	3	6	7732	7737	0 %	50 %	0 %	50 %	172034869
123	NC_010541	T	6	6	7774	7779	0 %	100 %	0 %	0 %	172034869
124	NC_010541	TCG	2	6	7870	7875	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034869
125	NC_010541	TAGGAG	2	12	8037	8048	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	172034869
126	NC_010541	CTTT	2	8	8088	8095	0 %	75 %	0 %	25 %	172034869
127	NC_010541	GTT	2	6	8154	8159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
128	NC_010541	T	6	6	8215	8220	0 %	100 %	0 %	0 %	172034869
129	NC_010541	TAAT	2	8	8250	8257	50 %	50 %	0 %	0 %	172034869
130	NC_010541	GAT	2	6	8280	8285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
131	NC_010541	T	6	6	8367	8372	0 %	100 %	0 %	0 %	172034869
132	NC_010541	ATT	2	6	8381	8386	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034869
133	NC_010541	T	8	8	8432	8439	0 %	100 %	0 %	0 %	172034869
134	NC_010541	TTC	2	6	8500	8505	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
135	NC_010541	CTT	2	6	8560	8565	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
136	NC_010541	ATG	2	6	8577	8582	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
137	NC_010541	AGT	2	6	8587	8592	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
138	NC_010541	GAA	2	6	8630	8635	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034869
139	NC_010541	CAA	2	6	8637	8642	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034869
140	NC_010541	CTT	2	6	8679	8684	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
141	NC_010541	CTTT	2	8	8699	8706	0 %	75 %	0 %	25 %	172034869
142	NC_010541	TAA	2	6	8749	8754	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
143	NC_010541	TA	3	6	8820	8825	50 %	50 %	0 %	0 %	172034869
144	NC_010541	ACTA	2	8	8941	8948	50 %	25 %	0 %	25 %	172034869
145	NC_010541	TTG	2	6	8992	8997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
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147	NC_010541	ATCT	2	8	9102	9109	25 %	50 %	0 %	25 %	172034869
148	NC_010541	GTT	2	6	9258	9263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034869
149	NC_010541	GACT	2	8	9279	9286	25 %	25 %	25 %	25 %	172034869
150	NC_010541	ATG	2	6	9304	9309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
151	NC_010541	TCCT	2	8	9382	9389	0 %	50 %	0 %	50 %	172034869
152	NC_010541	T	6	6	9459	9464	0 %	100 %	0 %	0 %	172034869
153	NC_010541	GAAAT	2	10	9590	9599	60 %	20 %	20 %	0 %	172034869
154	NC_010541	CGG	2	6	9603	9608	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034869
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157	NC_010541	CGG	2	6	9705	9710	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	172034869
158	NC_010541	AAC	2	6	9734	9739	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034869
159	NC_010541	TAA	2	6	9769	9774	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
160	NC_010541	GCT	2	6	9782	9787	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034869
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163	NC_010541	AGT	2	6	9973	9978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034869
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168	NC_010541	AGC	2	6	10195	10200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034869
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170	NC_010541	TTAA	2	8	10238	10245	50 %	50 %	0 %	0 %	172034869
171	NC_010541	TAA	2	6	10303	10308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034869
172	NC_010541	TTC	2	6	10351	10356	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034869
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184	NC_010541	TCGT	2	8	11131	11138	0 %	50 %	25 %	25 %	172034869
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247	NC_010541	CTG	3	9	15010	15018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	172034874
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250	NC_010541	TTC	2	6	15262	15267	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034874
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252	NC_010541	A	7	7	15295	15301	100 %	0 %	0 %	0 %	172034874
253	NC_010541	GTT	2	6	15306	15311	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034874
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260	NC_010541	CCT	2	6	15822	15827	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034875
261	NC_010541	TTC	2	6	15859	15864	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034875
262	NC_010541	ATT	2	6	15874	15879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034875
263	NC_010541	TCC	2	6	15914	15919	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034875
264	NC_010541	ATC	2	6	15943	15948	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034875
265	NC_010541	TAT	2	6	15960	15965	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034875
266	NC_010541	GATT	2	8	15983	15990	25 %	50 %	25 %	0 %	172034875
267	NC_010541	AAT	2	6	16041	16046	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034875
268	NC_010541	GATT	2	8	16124	16131	25 %	50 %	25 %	0 %	172034875
269	NC_010541	TTG	2	6	16138	16143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034875
270	NC_010541	TAA	2	6	16165	16170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034875
271	NC_010541	TCT	2	6	16209	16214	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	172034875
272	NC_010541	TGT	2	6	16235	16240	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034875
273	NC_010541	GTT	2	6	16245	16250	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034875
274	NC_010541	TTG	2	6	16273	16278	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	172034875
275	NC_010541	TGA	2	6	16317	16322	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034875
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278	NC_010541	ATC	2	6	16637	16642	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034876
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280	NC_010541	CAT	2	6	16730	16735	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	172034876
281	NC_010541	TTTG	2	8	16753	16760	0 %	75 %	25 %	0 %	172034876
282	NC_010541	AGA	2	6	16803	16808	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034876
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284	NC_010541	ATT	2	6	16853	16858	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034876
285	NC_010541	AGA	2	6	16884	16889	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	172034876
286	NC_010541	CAC	2	6	16900	16905	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034876
287	NC_010541	CTC	2	6	16916	16921	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034876
288	NC_010541	CT	3	6	16949	16954	0 %	50 %	0 %	50 %	172034876
289	NC_010541	TGA	2	6	16964	16969	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034876
290	NC_010541	CAG	2	6	17023	17028	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	172034876
291	NC_010541	AAT	2	6	17056	17061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034876
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293	NC_010541	T	6	6	17075	17080	0 %	100 %	0 %	0 %	172034876
294	NC_010541	GGA	2	6	17158	17163	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	172034876
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296	NC_010541	GGT	2	6	17624	17629	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	172034877
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299	NC_010541	CATTGA	2	12	18133	18144	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	172034878
300	NC_010541	CTC	2	6	18194	18199	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	172034878
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313	NC_010541	TGTA	2	8	19220	19227	25 %	50 %	25 %	0 %	172034879
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324	NC_010541	TAA	2	6	19550	19555	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	172034879
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334	NC_010541	A	6	6	19948	19953	100 %	0 %	0 %	0 %	172034880
335	NC_010541	CTAA	2	8	19975	19982	50 %	25 %	0 %	25 %	172034880
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380	NC_010541	ACC	2	6	22779	22784	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	172034884
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387	NC_010541	AGTCA	2	10	22925	22934	40 %	20 %	20 %	20 %	172034884
388	NC_010541	TAT	2	6	22952	22957	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	172034884
389	NC_010541	AAC	2	6	22971	22976	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	172034884
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392	NC_010541	CTAC	2	8	23161	23168	25 %	25 %	0 %	50 %	172034884
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500	NC_010541	ATG	3	9	27949	27957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	172034884

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